Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms