Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SYT9Q86SS6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms