Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms