Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A10Q6U841 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC4A10Q6U841 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms