Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms