Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC158Q5M9N0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms