Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC93Q567U6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms