Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms