Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL12Q53G59 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms