Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NBPF8Q3BBV2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NBPF8Q3BBV2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms