Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL38Q2WGJ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms