Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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