Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCK2Q16822 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCK2Q16822 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms