Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GRIK5Q16478 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK5Q16478 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms