Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKIV2LQ15477 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms