Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYCP1Q15431 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms