Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDGFRLQ15198 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDGFRLQ15198 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms