Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERV3-1Q14264 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms