Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CKAP5Q14008 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms