Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1CQ13936 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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