Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ATRQ13535 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRQ13535 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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