Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XRCC4Q13426 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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