Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAF1AQ13111 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHAF1AQ13111 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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