Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MRPL28Q13084 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MRPL28Q13084 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms