Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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