Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLEQ07864 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLEQ07864 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms