Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TFF3Q07654 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms