Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNG1Q06432 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms