Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE3AQ05086 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE3AQ05086 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms