Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GBE1Q04446 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms