Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC6Q03468 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC6Q03468 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms