Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PLOD1Q02809 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms