Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms