Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDM2Q00987 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms