Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms