Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMF1P82094 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMF1P82094 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMF1P82094 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMF1P82094 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMF1P82094 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TMF1P82094 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMF1P82094 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMF1P82094 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMF1P82094 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMF1P82094 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMF1P82094 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMF1P82094 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMF1P82094 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms