Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EMP1P54849 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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EMP1P54849 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EMP1P54849 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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