Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLK1P49759 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms