Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRP9P49458 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRP9P49458 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRP9P49458 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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