Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPAP49450 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPAP49450 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPAP49450 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPAP49450 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPAP49450 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms