Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTBP49356 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FNTBP49356 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FNTBP49356 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms