Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX2P48431 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX2P48431 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms