Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRXP46100 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATRXP46100 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATRXP46100 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRXP46100 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms