Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPOP42166 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPOP42166 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMPOP42166 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMPOP42166 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPOP42166 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPOP42166 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms