Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGAEP38570 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGAEP38570 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms