Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms