Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms