Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms