Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms