Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA7P31268 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA7P31268 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms